1,135 Genomes Reveal the Global Pattern of Polymorphism in Arabidopsis thaliana

Authors/others:Alonso-Blanco, Carlos (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Andrade, Jorge (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Becker, Claude (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Bemm, Felix (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Bergelson, Joy (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Borgwardt, Karsten M. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Cao, Jun (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Chae, Eunyoung (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Dezwaan, Todd M. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Ding, Wei (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Ecker, Joseph R. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Exposito-Alonso, Moises (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Farlow, Ashley (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Fitz, Joffrey (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Gan, Xiangchao (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Grimm, Dominik G. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Hancock, Angela M. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Henz, Stefan R. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Holm, Svante (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Horton, Matthew (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Jarsulic, Mike (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Kerstetter, Randall A. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Korte, Arthur (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Korte, Pamela (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Lanz, Christa (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Lee, Cheng-Ruei (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Meng, Dazhe (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Michael, Todd P. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Mott, Richard (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Muliyati, Ni Wayan (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Nägele, Thomas; Nagler, Matthias; Nizhynska, Viktoria (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Nordborg, Magnus (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Novikova, Polina Yu. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Pico, F. Xavier (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Platzer, Alexander (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Rabanal, Fernando A. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Rodriguez, Alex (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Rowan, Beth A. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Salome, Patrice A. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Schmid, Karl J. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Schmitz, Robert J. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Seren, Umit (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Sperone, Felice Gianluca (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Sudkamp, Mitchell (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Svardal, Hannes (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Tanzer, Matt M. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Todd, Donald (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Volchenboum, Samuel L. (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Wang, Congmao (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Wang, George (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Wang, Xi (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Weckwerth, Wolfram; Weigel, Detlef (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie); Zhou, Xuefeng (Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie);,
Abstract:Arabidopsis thaliana serves as a model organism for the study of fundamental physiological, cellular, and molecular processes. It has also greatly advancedour understanding of intraspecific genome variation. We present a detailed map of variation in 1,135 high-quality re-sequenced natural inbred lines representingthe native Eurasian and North African range and recently colonized North America. We identify relict populations that continue to inhabit ancestral habitats, primarily in the Iberian Peninsula. They have mixed with a lineage that has spread to northern latitudes from an unknown glacial refugium and is now found in a much broader spectrum of habitats. Insights into the history of the species and the finescale distribution of genetic diversity provide the basis for full exploitation of A. thaliana natural variation through integration of genomes and epigenomes with molecular and non-molecular phenotypes.
Language:English
Number of pages:11
Date of publication:14.7.2016
Journal title:Cell
Volume:166
Number:2
Pages:481-491
Peer reviewed:true
Links:
Digital Object Identifier (DOI):http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2016.05.063
Publication Type:Article
Portal:https://ucris.univie.ac.at/portal/en/publications/1135-genomes-reveal-the-global-pattern-of-polymorphism-in-arabidopsis-thaliana(e8a0337c-0241-4041-b78a-846cae350f32).html