Publikationen

Automated protein turnover calculations from 15N partial metabolic labeling LC/MS shotgun proteomics data. / Lyon, David; Castillejo, Maria Angeles; Staudinger, Christiana et al.
in: PLoS ONE, Band 9, Nr. 4, e94692, 15.04.2014.

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Solving the differential biochemical Jacobian from metabolomics covariance data. / Nägele, Thomas; Mair, Andrea; Sun, Xiaoliang et al.
in: PLoS ONE, Band 9, Nr. 4, e92299, 02.04.2014.

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Metabolism and development - integration of micro computed tomography data and metabolite profiling reveals metabolic reprogramming from floral initiation to silique development. / Bellaire, Anke; Ischebeck, Till; Städler, Yannick et al.
in: New Phytologist, Band 202, Nr. 1, 04.2014, S. 322-335.

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Poly(ADP-Ribose)Polymerase Activity Controls Plant Growth by Promoting Leaf Cell Number. / Schulz, Philipp; Jansseune, Karel; Degenkolbe, Thomas et al.
in: PLoS ONE, Band 9, Nr. 2, e90322, 28.02.2014.

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Myo-inositol oxygenase is important for the removal of excess myo-inositol from syncytia induced by Heterodera schachtii in Arabidopsis roots. / Siddique, Shahid; Endres, Stefanie; Sobczak, Miroslaw et al.
in: New Phytologist, Band 201, Nr. 2, 01.2014, S. 476-485.

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An improved detergent-compatible gel-fractionation LC-LTQ-Orbitrap-MS workflow for plant and microbial proteomics. / Valledor, Luis; Weckwerth, Wolfram.
Plant Proteomics: Methods and Protocols - Methods in Molecular Biology. Hrsg. / Jesus V. Jorrin-Novo; Setsuko Komatsu; Wolfram Weckwerth; Stefanie Wienkoop. Band 1072 New York [u.a.]: Humana Press, 2014. S. 347-358.

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Draft Genome Sequence of the Growth-Promoting Endophyte Paenibacillus sp. P22, Isolated from Populus. / Hanak, Anne-Mette; Nagler, Matthias; Weinmaier, Thomas et al.
in: Genome Announcements, Band 2, Nr. 2, e00276-14, 2014, S. e00276-14.

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From proteomics to systems biology: MAPA, MASS WESTERN, PROMEX, and COVAIN as a user-oriented platform. / Weckwerth, Wolfram ; Wienkoop, Stefanie; Hoehenwarter, Wolfgang et al.
in: Methods in Molecular Biology, Band 1072, 2014, S. 15-27.

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Mass Western for absolute quantification of target proteins and considerations about the instrument of choice. / Lyon, David; Weckwerth, Wolfram ; Wienkoop, Stefanie.
Plant Proteomics : Methods in Molecular Biology. Band 1072 Humana Press, Inc., 2014. S. 199-208 (Methods in Molecular Biology, Band 1072).

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Medicago truncatula proteomics for systems biology: Novel rapid shotgun LC-MS approach for relative quantification based on full-scan selective peptide extraction (Selpex). / Castillejo, M Angeles; Staudinger, Christiana; Egelhofer, Volker et al.
Plant Proteomics: Methods and Protocols. Band 1072 Humana Press, Inc., 2014. S. 303-313 (Methods in Molecular Biology, Band 1072).

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Phosphorylation of Arabidopsis transketolase at Ser ⁴²⁸ provides a potential paradigm for the metabolic control of chloroplast carbon metabolism. / Rocha, Agostinho G; Mehlmer, Norbert; Stael, Simon et al.
in: Biochemical Journal, Band 458, Nr. 2, 2014, S. 313-322.

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System Level Network Analysis of Nitrogen Starvation and Recovery in Chlamydomonas reinhardtii reveals potential new targets for increased lipid accumulation. / Valledor, Luis; Furuhashi, Takeshi; Recuenco-Munoz, Luis et al.
in: Biotechnology for Biofuels, Band 7, Nr. 1, 171, 2014, S. 171.

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Tandem Metal-Oxide Affinity Chromatography for Enhanced Depth of Phosphoproteome Analysis. / Beckers, Gerold J M; Höhenwarter, Wolfgang; Röhrig, Horst et al.
Plant Proteomics: Methods and Protocols. Hrsg. / Jesus V. Jorrin-Novo; Setsuko Komatsu; Wolfram Weckwerth; Stefanie Wienkoop. Band 1072 Humana Press, 2014. S. 621-632 (Methods in Molecular Biology, Band 1072).

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A workflow for mathematical modeling of subcellular metabolic pathways in leaf metabolism of Arabidopsis thaliana. / Nägele, Thomas; Weckwerth, Wolfram.
in: Frontiers in Plant Science, Band 4, 24.12.2013, S. 541.

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Identification of putative new tomato allergens and differential interaction with IgEs of tomato allergic subjects. / Welter, Saskia; Lehmann, K.; Doelle, S. et al.
in: Clinical and Experimental Allergy, Band 43, Nr. 12, 12.2013, S. 1419-1427.

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Cell-specific Analysis of the Tomato Pollen Proteome from Pollen Mother Cell to Mature Pollen Provides Evidence for Developmental Priming. / Chaturvedi, Palak; Ischebeck, Till; Egelhofer, Volker et al.
in: Journal of Proteome Research, Band 12, Nr. 11, 01.11.2013, S. 4892-4903.

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Indian Grape Wines: A Potential Source of Phenols, Polyphenols, and Antioxidants. / Ghatak, Arindam A.; Chaturvedi, Palak A.; Desai, Neetin S.
in: International Journal of Food Properties, 11.2013.

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INPPO Actions and Recognition as a Driving Force for Progress in Plant Proteomics: Change of Guard, INPPO Update, and Upcoming Activities. / Agrawal, Ganesh Kumar; Job, Dominique; Kieselbach, Thomas et al.
in: Proteomics, Band 13, Nr. 21, 11.2013, S. 3093-3100.

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The plasma membrane proteome of maize roots grown under low and high iron conditions. / Hopff, David; Wienkoop, Stefanie; Lüthje, Sabine.
in: Journal of Proteomics, Band 91, 08.10.2013, S. 605-618.

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Comprehensive cell-specific protein analysis in early and late pollen development from diploid microsporocytes to pollen tube growth. / Ischebeck, Till; Valledor, Luis; Lyon, David et al.
in: Molecular and Cellular Proteomics, Band 13, Nr. 1, 27.09.2013, S. 295-310.

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