Publikationen

Integration of multi-omics data and deep phenotyping provides insights into responses to single and combined abiotic stress in potato. / Zagorščak, Maja; Abdelhakim, Lamis; Rodriguez-Granados, Natalia Yaneth et al.
in: Plant Physiology, Band 197, Nr. 4, 28.03.2025.

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Coupling activated sludge models and population balance models to predict size distribution dynamics of nitrifier microcolonies in sludge flocs. / Totis, Niccolò; Christiaens, An Sofie; Smets, Ilse et al.
in: Journal of Water Process Engineering, Band 71, 107085, 03.2025.

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Niche creation improves bioaugmentation of an organic micropollutant degrader in oligotrophic waters. / Wang, Jinsong; Raes, Bart; Debrabandere, Cato et al.
in: ISME Journal, Band 19, Nr. 1, wraf140, 01.01.2025.

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Dynamic Bioreactor Model of Polyhydroxybutyrate Production from Methane: Investigating Various Feeding Strategies: ACS Sustainable Chemistry & Engineering. / Nasershariat, Mohadeseh; Pishvaie, Mahmoud R; Bozorgmehry, Ramin Boozarjomehry et al.
in: ACS Sustainable Chem. Eng., Band 13, Nr. 31, 2025, S. 12337-12344.

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Enhanced metabolomic predictions using concept drift analysis: identification and correction of confounding factors. / Schwarzerova, Jana; Olesova, Dominika; Jureckova, Katerina et al.
in: Bioinformatics advances, Band 5, Nr. 1, 2025, S. vbaf073.

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Multi-Objective Optimization of Biomass and Riboflavin Production Using Dynamic Flux Balance Analysis: A Study of Methylocystis Hirsuta. / Nasershariat, Mohadeseh; Pishvaie, Mahmoud Reza; Boozarjomehry, Ramin Bozorgmehry et al.
Proceedings of the 11th World Congress on New Technologies, NewTech 2025. Hrsg. / Devika Chithrani; Domenico Lombardo. Avestia Publishing, 2025. (Proceedings of the World Congress on New Technologies).

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Ultrastructural analysis of Clusia chloroplasts with varying CAM physiotypes. / Bellaire, Anke; Ulrich, Silvia ; Bachmann, Gert et al.
25th Conference of the Austrian Society of Plant Biology: Book of Abstracts. Universität für Bodenkultur Wien (BOKU), 2025. S. 57 P7.

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Comparative analysis of geotypic variations in the proteome of Nostoc commune. / Routray, Deepti; Ghatak, Arindam ; Chaturvedi, Palak et al.
in: Plant Signaling & Behavior, Band 19, Nr. 1, 2370719, 31.12.2024.

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Polygenic Risk Score Simulation: A case study of sudden cardiovascular diseases derived from literature insights. / Schwarzerova, Jana; Piherova, Lenka; Polakovicova, Petra et al.
2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine. Hrsg. / Mario Cannataro; Huiru Zheng; Lin Gao; Jianlin Cheng; Joao Luis de Miranda; Ester Zumpano; Xiaohua Hu; Young-Rae Cho; Taesung Park. 2024. S. 5081-5088 (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine).

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A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria. / Arthofer, Patrick; Panhölzl, Florian; Delafont, Vincent et al.
in: Nature Communications, Band 15, Nr. 1, 3307, 12.2024.

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Natural variation in the chickpea metabolome under drought stress. / Chaturvedi, Palak (Korresp. Autor*in); Pierides, Iro ; López-Hidalgo, Cristina et al.
in: Plant Biotechnology Journal, Band 22, Nr. 12, 12.2024, S. 3278-3294.

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Network structure and fluctuation data improve inference of metabolic interaction strengths with the inverse Jacobian. / Li, Jiahang; Weckwerth, Wolfram ; Waldherr, Steffen.
in: Npj systems biology and applications, Band 10, Nr. 1, 137, 12.2024.

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Where to after COVID-19? Systems thinking for a human-centred approach to pandemics. / Mormina, Maru; Müller, Bernhard; Caniglia, Guido et al.
in: Humanities and Social Sciences Communications, Band 11, Nr. 1, 733, 12.2024.

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Omics Technologies: A Strategy to Expedite the Geographical Traceability and Authenticity of Palm Oil. / Rozali, Nurul Liyana; Ramli, Umi Salamah; Singh, Rajinder et al.
in: Food and Bioprocess Technology, 18.11.2024.

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CAM evolution is associated with gene family expansion in an explosive bromeliad radiation. / Groot Crego, Clara (Korresp. Autor*in); Hess, Jaqueline; Yardeni, Gil et al.
in: The Plant Cell, Band 36, Nr. 10, 03.10.2024, S. 4109-4131.

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Accelerating wheat improvement through trait characterization: advances and perspectives. / Roychowdhury, Rajib; Ghatak, Arindam; Kumar, Manoj et al.
in: Physiologia Plantarum, Band 176, Nr. 5, e14544, 10.2024, S. e14544.

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Procyanidin A1 and its digestive products inhibit acrylamide-induced IPEC-J2 cell damage: apoptosis and cell cycle arrest. / Yan, Fangfang; Quin, Si; Wang, Chengmin et al.
in: Food Science and Human Wellness, 04.09.2024.

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Integrative tissue-resolved proteomics and metabolomics analysis of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) fruit provides insights into stilbenoid biosynthesis at the interface of primary and secondary metabolism. / Hassan, Hasliza; Tahir, Noor Idayu; Rozali, Nurul Liyana et al.
in: Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, Band 60, 103308, 09.2024.

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Machine learning and data-driven inverse modeling of metabolomics unveil key process of active aging. / Li, Jiahang; Brenner, Martin; Pierides, Iro et al.
2024.

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Visualizing Horizontal Gene Transfer Detection in Phylogenetically Divergent Bacteria. / Schwarzerova, Jana (Korresp. Autor*in); Rajasekaran, Laxmipriya; Jureckova, Katerina et al.
Bioinformatics and Biomedical Engineering - 11th International Conference, IWBBIO 2024, Proceedings. Hrsg. / Ignacio Rojas; Francisco Ortuño; Fernando Rojas; Luis Javier Herrera; Olga Valenzuela. Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2024. S. 267-277 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Band 14849 LNBI).

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